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(Page design: 29. Sep. 2008; last modification: 19. Nov. 2008)

 

'Orphan' PKS in Huperzia serrata

 

     Dies ist ein ziemlich ungewöhnliches Beispiel; sehen Sie sich den Abstrakt der Publikation an: Wanibuchi et al., 2007. Die cDNA wurde aus dem 'Chinese club moss' kloniert,  Huperzia serrata  (Huperziaceae). Das Protein hatte nur 44-66% Identität mit anderen Typ III PKS, und es hatte einige ungewöhnliche Eigenschaften. Zum mindesten in vitro funktionierte es genau wie eine richtige CHS, eine richtige Benzophenon-Synthase (BPS), und eine richtige Acridonsynthase (ACS). Aber auch hier zeigten nicht alle Produkte die vollständige CHS-Typ Reaktion: Es gab alle Arten von Pyron-Produkten nach zwei oder drei Kondensations-Reaktionen, d.h. den Typ von Nebenprodukten, wie sie mit vielen anderen Typ III PKS gefunden wurden. Bemerkenswert ist, dass dies die erste Demonstration einer ACS Aktivität einer Typ III PKS ist, die nicht aus einer Rutaceae Art stammt. Eine erst Kristall-Struktur ist auch bereits vorhanden (Morita et al., 2007).

     Die physiologische Rolle dieses  Proteins blieb obskur, und deshalb sollte das Protein, zum mindestens zur Zeit, als 'Orphan PKS' bezeichnet werden.

 

Warum ist dieses Moos interessant?
  
Es enthält
Huperzin A, ein Sesquiterpen-Alkaloid. Extrakte aus dieser Pflanze wurden offensichtlich seit Jahrhunderten in der chinesischen Medizin für eine Vielzahl von Leiden verwendet, und auch heute hat es interessante Anwendungen; siehe z.B. die Seiten in Wikipedia: english und deutsch.

 

Zitate

  • Morita, H., Kondo, S., Kato, R., Wanibuchi, K., Noguchi, H., Sugio, S., Abe, I., Kohno, T., 2007. Crystallization and preliminary crystallographic analysis of an acridone-producing novel multifunctional type III polyketide synthase from Huperzia serrata. Acta Crystallograph. Sect. F. Struct. Biol. Cryst. Commun. F63, 576-578.
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  • Wanibuchi, K., Zhang, P., Abe, T., Morita, H., Kohno, T., Chen, G., Noguchi, H., Abe, I., 2007. An acridone-producing novel multifunctional type III polyketide synthase from Huperzia serrata. FEBS Journal 274, 1073-1082.
       A cDNA encoding a novel plant type III polyketide synthase was cloned and sequenced from the Chinese club moss Huperzia serrata (Huperziaceae). The deduced amino acid sequence of Hu. serrata polyketide synthase 1 showed 44-66% identity to those of other chalcone synthase superfamily enzymes of plant origin. Further, phylogenetic tree analysis revealed that Hu. serrata polyketide synthase 1 groups with other nonchalcone-producing type III polyketide synthases. Indeed, a recombinant enzyme expressed in Escherichia coli showed unusually versatile catalytic potential to produce various aromatic tetraketides, including chalcones, benzophenones, phloroglucinols, and acridones. In particular, it is remarkable that the enzyme accepted bulky starter substrates such as 4-methoxycinnamoyl-CoA and N-methylanthraniloyl-CoA, and carried out three condensations with malonyl-CoA to produce 4-methoxy-2',4',6'-trihydroxychalcone and 1,3-dihydroxy-N-methylacridone, respectively. In contrast, regular chalcone synthase does not accept these bulky substrates, suggesting that the enzyme has a larger starter substrate-binding pocket at the active site. Although acridone alkaloids have not been isolated from Hu. serrata, this is the first demonstration of the enzymatic production of acridone by a type III polyketide synthase from a non-Rutaceae plant. Interestingly, Hu. serrata polyketide synthase 1 lacks most of the consensus active site sequences with acridone synthase from Ruta graveolens (Rutaceae).
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Links zu anderen Beispielen von 'Orphan PKS'

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